昆明醫藥職業技術學校是經昆明市教育局批準，云南省教育廳備案的具有開展中等職業教育、高等醫學教育考試入學（中升專、專升本）輔導，及聯合相關院校進行成人高等醫學教育的辦學資質和功能。
學校始建于1998年，當時主要是根據全國第三次教育工作會議精神，為創建昆明醫學院高職教學院和海源學院奠定了基礎并輸送了生源。學校開設有醫藥類、信息類、管理類等專業。發展至今已有16年的歷史，積累了一定的辦學經驗，也取得了一定的成績。為社會培養輸送了20000余名醫藥技術人才。多年來，就業率均保持在98%以上，學生遍布全省，部分成為企事業單位、醫療衛生等部門的業務骨干和領導。
學校教育設備齊全，師資力量雄厚。有教職工260余人，其中教授、副教授占教師總人數的38.1%；雙師型的教師占教師總數的77%。
學校堅定不移地走“教、學、做”合一的職業教育，使學生具備“一張文憑，多種證書”，成為一轉多用的復合型人才。
學校堅決貫徹中共云南省委、省人民政府“決不讓一個兄弟名族掉隊”的號召。招收部分名族、邊遠、貧困、農村的學生。
學校開辦“中升專”、“專升本”輔導班。由昆明醫科大、云南財經大學、云南師范大學、理工大學、云師大附中、昆明一中等院校的教授、專家進行授課。升學率達90%以上，在全省醫藥類院校中，成績名列前茅。凡就讀中專的同學，第三年可參加輔導班學習。通過全省統一組織的考試后，升入專科或本科院校學習。
學校先后與北京大學醫學網絡教育學院、北京中醫藥大學、紅河衛生職業學院、云南三鑫職業學院、云南開放大學長期合作辦學。中專學生第三年即可根據所學的專業，轉入以上院校學習。成績合格者，由所在院校頒發國家教育部門認可的畢業證書。
昆明醫藥職業技術學校與云南醫技培訓學校兩塊牌子一套班子，多年來共同做好康復治療護理、藥品營銷、康復理療（推拿按摩）、高新級飯店運營與管理、計算機應用、農產品保險與加工、幼兒教育、商品經營（電子商務方向）、生物技術制藥、物業管理、醫療器械維修與營銷、醫藥衛生財會（電子商務方向）、中草藥種植、眼鏡驗光、公共營養、心理咨詢等專業人才培養。合格者根據不同專業學校分別頒發由教育部門或云南省人力資源和社會保障廳、衛生部門驗印的畢業證或職業資格證書。
學校開設規模較大的駕校，在校期間愿意報名參加駕駛培訓，條件合格者，可以參加培訓。